ทฤษฎีของหน่วยงานและทฤษฎีผู้มีส่วนได้เสียทั้งสองใช้ในการทำความเข้าใจและอธิบายถึงความสัมพันธ์ประเภทต่างๆในธุรกิจ ทั้งสองทฤษฎีให้ความหมายเพื่อทำความเข้าใจกับความท้าทายทางธุรกิจ ปัญหาอาจเป็นผลมาจากข้อมูลที่ผิด ๆ ของแท้หรืออาจเกิดจากการปะทะกับผลประโยชน์ทางธุรกิจ ทฤษฎีเหล่านี้มักใช้ในการร่างผลประโยชน์ของผู้ถือหุ้นพนักงานลูกค้าประชาชนและผู้ขาย ความท้าทายมากมายที่ปรากฏในโลกธุรกิจอันเป็นผลมาจากข้อมูลที่ไม่สมบูรณ์ miscommunication และความขัดแย้งอาจอธิบายได้โดยใช้ทั้งสองทฤษฎี ทฤษฎีหน่วยงานอธิบายถึงปัญหาที่เกิดขึ้นเมื่อฝ่ายใดฝ่ายหนึ่งเป็นผู้ประกอบการในธุรกิจ แต่มีมุมมองที่แตกต่างกันในประเด็นทางธุรกิจที่สำคัญหรือผลประโยชน์ที่แตกต่างจากผู้บริหารหลัก ตัวแทนทำหน้าที่ในนามของอีกฝ่ายหนึ่งอาจไม่เห็นด้วยกับแนวทางที่ดีที่สุดและยินยอมให้ความเชื่อส่วนบุคคลมีอิทธิพลต่อผลของการทำธุรกรรม ตัวแทนอาจเลือกที่จะดำเนินการด้วยตัวเองแทนที่จะเป็นผลประโยชน์ของเจ้าหนี้ ซึ่งอาจส่งผลให้เกิดความขัดแย้งระหว่างทั้งสองฝ่ายและอาจเป็นปัญหาของเอเจนซี
ทฤษฎีผู้มีส่วนได้ส่วนเสียอธิบายถึงองค์ประกอบขององค์กรในรูปแบบของกลุ่มบุคคลหลายกลุ่มที่มีความสนใจแตกต่างกัน ความสนใจเหล่านี้นำมารวมกันแสดงถึงเจตนารมณ์ขององค์กร เท่าที่จะเป็นไปได้การตัดสินใจทางธุรกิจควรคำนึงถึงผลประโยชน์ของกลุ่มรวมนี้และพัฒนาความร่วมมือโดยรวม ความขัดแย้งหมายถึงการพังทลายของความสนใจเหล่านี้ การทำให้กลุ่มที่แตกต่างกันเหล่านี้เข้าด้วยกันเพื่อบรรลุข้อตกลงอาจไม่เป็นไปได้เสมอไปดังนั้นการตัดสินใจทางธุรกิจต้องคำนึงถึงแต่ละมุมมองและเพิ่มประสิทธิภาพในการตัดสินใจให้ครอบคลุมทุกเสียง