มูลค่าตามบัญชีของพันธบัตรคือจำนวนเงินสุทธิระหว่างมูลค่าของพันธบัตรและส่วนของค่าเบี้ยประกันภัยที่ยังไม่เบิกใช้หรือลบด้วยมูลค่าส่วนลดที่ตัดจำหน่าย มูลคาตามบัญชีเปนมูลคาตามบัญชีหรือมูลคาตามบัญชีของตราสารหนี้ เนื่องจากอัตราดอกเบี้ยมีความผันผวนอย่างต่อเนื่องพันธบัตรจึงไม่ค่อยมีการขายที่มูลค่าเท่ากัน แต่จะขายในราคาพิเศษหรือส่วนลดตามมูลค่าที่ตราไว้ทั้งนี้ขึ้นอยู่กับความแตกต่างระหว่างอัตราดอกเบี้ยปัจจุบันและอัตราดอกเบี้ยที่ระบุไว้สำหรับตราสารหนี้ในวันที่ออกตราสาร ส่วนเกินและส่วนลดตัดจำหน่ายตลอดอายุของตราสารหนี้ดังนั้นมูลค่าตามบัญชีเท่ากับมูลค่าที่ตราไว้ ณ วันครบกำหนด
ขั้นตอนแรกในการคำนวณมูลค่าตามบัญชีคือการกำหนดเงื่อนไขของพันธบัตร พันธบัตรแต่ละประเภทมี 3 ลักษณะ ได้แก่ มูลค่าหุ้นกู้อัตราดอกเบี้ยและระยะเวลาครบกำหนดจากนั้นจะต้องพิจารณาว่าพันธบัตรขายที่มูลค่าตามราคาที่เบี้ยประกันภัยหรือส่วนลด พันธบัตรที่มีอัตราดอกเบี้ยเท่ากับอัตราดอกเบี้ยในตลาดปัจจุบันที่ขายได้ ถ้าอัตราดอกเบี้ยของพันธบัตรสูงกว่าอัตราตลาดในปัจจุบันพันธบัตรจะขายที่ระดับพรีเมี่ยม ถ้าอัตราดอกเบี้ยของพันธบัตรต่ำกว่าอัตราตลาดปัจจุบันจะขายที่เหลือ ระยะเวลาที่ได้ผ่านการออกพันธบัตรจะต้องเป็นไปตามที่กำหนดไว้เนื่องจากเบี้ยประกันภัยหรือส่วนลดจะตัดจำหน่ายตลอดอายุของตราสารหนี้